А если попробовать восстановить загрузочный сектор? Или сначала сделать low level формат, затем восстановить сектор? Восстановление загрузчика попробовать либо с Alkid Live cd, на торрентах есть апрельский, на нем вообще очень много утилит для hdd. Я бы его сначала поковырял, проверил, затем попробовал с того же livecd утилитку mbrfix. как вариант - команда fixmbr из консоли восстановления windows.
http://www.ambience.sk/experiments/MbrFix.exe - утилитка, с ее помощью можно попробовать восстановить загрузчик. Либо. Консоль восстановления - "fdisk /mbr"